Festplatte klonen (aber nur teilweise)?

Mein PC startet immer noch über eine HDD Festplatte, obwohl ich seit ü 2 Jahren noch eine SSD verbaut habe.

Damals hat es aber nicht funktioniert, also wollte ich es nochmal versuchen.

Mein Ansatz war, die gesamte Festplatte zu klonen und anschließend im Bios zu ändern, von welcher Festplatte aus gebootet werden soll.

Mittlerweile würde das gar nicht mehr gehen, da die SSD nur 500GB Speicher hat und in 2 Jahren natürlich einiges hinzugekommen ist.

Also zu meiner eigentlichen Frage:

(Wie) Kann ich nur den Teil klonen, welcher zum Booten notwendig ist?

Die ganzen Programme, Bilder, etc. können/sollen gerne weiter auf der orginal HDD bleiben- mir geht es nur darum, dass das Starten des PC's beschleunigt wird.
LG

:)